中国文明起源解明の新・考古学イニシアティブ

【情報提供】7/27(水)パレオゲノミクス研究ワークショップ

パレオゲノミクス研究ワークショップ From Ancient Substrates to Genomes (C02班覚張隆史先生より情報提供)
 
 この度、金沢大学とダブリン大学の共同研究の一環として、古人骨のパレオゲノミクス研究における側頭骨サンプリング技術に関するワークショップを7月27日13時30分〜14時30分にオンラインにて開催することとなりましたのでお知らせいたします。
 側頭骨のサンプリング法が世に出た2014年からすでに8年が経過していますが、今もなお各研究室でサンプリングの手順は微妙に異なっており、この違いは古代ゲノム配列の取得効率にも大きく影響することがわかってきています。
 本会は側頭骨のサンプリング法を初めて開発したダブリン大学からパレオゲノミクス研究室ラボマネージャーのValeria Mattiangeli先生をお招きし、パレオゲノミクス研究における最新のサンプリング法とDNA抽出法について情報共有していただき、日本の研究者との技術交流を目的としております。
 すでにパレオゲノミクス研究に着手されている研究者だけでなく、パレオゲノミクス研究がどのように進められているか実際の分析現場を知りたい研究者や学生のご参加を心よりお待ちしております。
 金沢大学 古代文明・文化資源学研究所
 考古科学部門 覚張隆史
 
ご参加の際は、下記のZoom URLからご入室ください。
Title: From Ancient Substrates to Genomes
Time: Jul 27, 2022 01:30 PM Osaka, Sapporo, Tokyo
Meeting ID: 915 6079 1039  Passcode: 094997
 
Speaker: Valeria Mattiangeli (Trinity College, Dublin)
Dr. Mattiangeli has a degree in Zoology from the University of Milan and a PhD in Population Genetics from the National University of Ireland, Cork.
She has been working in Trinity College Dublin as a research fellow since 2003 and involved in a variety of projects including the identification of natural selection in the Irish population and bovine genes relevant in TB resistance/susceptibility. About 10 years ago, she started paleogenomics both in humans and domesticates. To date she has processed over 400 human ancient samples and over 200 ancient domesticates plus several unusual ancient substrates. As a senior researcher and a lab manager her central duties consist in updating protocols for ancient DNA, managing all NGS sequencing from our lab (Illumina platform), supervising undergraduate and Ph.D students and skill transfer to new researchers or collaborators.
Please find below some of the most recent her publications:
  • ・Ariano B, Mattiangeli V, Breslin EM, Parkinson EW, McLaughlin TR, Thompson JE, Power RK, Stock JT, Mercieca-Spiteri B, Stoddart S, Malone C, Gopalakrishnan S, Cassidy LM, Bradley DG. Ancient Maltese genomes and the genetic geography of Neolithic Europe. Curr Biol. 2022 Jun 20;32(12)
  • ・Cooke NP, Mattiangeli V, Cassidy LM, Okazaki K, Stokes CA, Onbe S, Hatakeyama S, Machida K, Kasai K, Tomioka N, Matsumoto A, Ito M, Kojima Y, Bradley DG, Gakuhari T, Nakagome S. Ancient genomics reveals tripartite origins of Japanese populations. Sci Adv. 2021 Sep 17;7(38)
  • ・Daly KG, Mattiangeli V, Hare AJ, Davoudi H, Fathi H, Doost SB, Amiri S, Khazaeli R, Decruyenaere D, Nokandeh J, Richter T, Darabi H, Mortensen P, Pantos A, Yeomans L, Bangsgaard P, Mashkour M, Zeder MA, Bradley DG. Herded and hunted goat genomes from the dawn of domestication in the Zagros Mountains. Proc Natl Acad Sci U S A. 2021 Jun 22;118(25)
  • ・Cassidy LM, O’ Maold’in R, Kador T, Lynch A, Jones C, Woodman PC, Murphy E, Ramsey G, Dowd M, Noonan A, Campbell C, Jones ER, Mattiangeli V, Bradley DG. A dynastic elite in monumental Neolithic society. Nature. 2020 Jun;582(7812)